Home Cytoskeletal Signaling HDAC inhibitor Abexinostat (PCI-24781)

연구용

Abexinostat (PCI-24781) HDAC inhibitor

제품 번호: S1090

Abexinostat (PCI-24781, CRA-024781) is a novel pan-HDAC inhibitor that mostly targets HDAC1 with Ki of 7 nM. It shows modest potency to HDACs 2, 3, 6, and 10 and greater than 40-fold selectivity against HDAC8. This compound is currently in Phase 1/2.
Abexinostat (PCI-24781) HDAC inhibitor Chemical Structure

화학 구조

분자량: 397.42

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품질 관리 (Quality Control)

배치: 순도: 99.21%
99.21

세포 배양, 처리 및 작업 농도
(Cell Culture, Treatment & Working Concentration)

세포주 분석 유형 농도 배양 시간 제형 활성 설명 PMID
HeLa Function assay 2 hrs Inhibition of dye-labeled tracer binding to HDAC10 (unknown origin) transfected in human HeLa cells measured after 2 hrs by nano-luciferase reporter gene-based BRET assay, IC50=0.007943μM 30964290
TC32 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for TC32 cells 29435139
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for DAOY cells 29435139
SJ-GBM2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SJ-GBM2 cells 29435139
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
BT-37 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-37 cells 29435139
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
U-2 OS qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for U-2 OS cells 29435139
Saos-2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Saos-2 cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB1643 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for LAN-5 cells 29435139
BT-12 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for BT-12 cells 29435139
Rh18 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh18 cells 29435139
OHS-50 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for OHS-50 cells 29435139
RD qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for RD cells 29435139
MG 63 (6-TG R) qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for MG 63 (6-TG R) cells 29435139
Rh30 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh30 cells 29435139
Rh41 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for Rh41 cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for NB1643 cells 29435139
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for A673 cells) 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for SK-N-MC cells 29435139
BT-12 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for BT-12 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for LAN-5 cells 29435139
DAOY qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for DAOY cells 29435139
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for NB-EBc1 cells 29435139
SJ-GBM2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for SJ-GBM2 cells 29435139
BT-37 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for BT-37 cells 29435139
TC32 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for TC32 cells 29435139
MG 63 (6-TG R) qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for MG 63 (6-TG R) cells 29435139
U-2 OS qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for U-2 OS cells 29435139
Rh41 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for Rh41 cells 29435139
RD qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for RD cells 29435139
Rh18 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for Rh18 cells 29435139
Rh30 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for Rh30 cells 29435139
Saos-2 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for Saos-2 cells 29435139
OHS-50 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for OHS-50 cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Confirmatory screen for SK-N-SH cells 29435139
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화학 정보, 보관 및 안정성 (Chemical Information, Storage & Stability)

분자량 397.42 화학식

C21H23N3O5

 보관 (수령일로부터)
CAS 번호 783355-60-2 SDF 다운로드 원액 보관

동의어 CRA-024781 Smiles CN(C)CC1=C(OC2=CC=CC=C21)C(=O)NCCOC3=CC=C(C=C3)C(=O)NO

용해도 (Solubility)

In vitro
배치:

DMSO : 80 mg/mL (201.29 mM)
(수분으로 오염된 DMSO는 용해도를 감소시킬 수 있습니다. 신선하고 무수 DMSO를 사용하십시오.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

몰농도 계산기

질량 농도 부피 분자량
희석 계산기 분자량 계산기

In vivo
배치:

생체 내 제형 계산기 (투명한 용액)

1단계: 아래 정보 입력 (권장: 실험 중 손실을 고려하여 추가 동물 포함)

mg/kg g μL

2단계: 생체 내 제형 입력 (이것은 계산기일 뿐 제형이 아닙니다. 용해도 섹션에 생체 내 제형이 없는 경우 먼저 당사에 문의하십시오.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

계산 결과:

작업 농도: mg/ml;

DMSO 원액 준비 방법: mg 약물 사전 용해 μL DMSO ( 원액 농도 mg/mL, 농도가 해당 약물 배치의 DMSO 용해도를 초과하는 경우 먼저 당사에 문의하십시오. )

생체 내 제형 준비 방법: 취하다 μL DMSO 원액, 다음 추가μL PEG300, 혼합하고 투명하게 한 다음 추가μL Tween 80, 혼합하고 투명하게 한 다음 추가 μL ddH2O, 혼합하고 투명하게 합니다.

생체 내 제형 준비 방법: 취하다 μL DMSO 원액, 다음 추가 μL 옥수수 기름, 혼합하고 투명하게 합니다.

참고: 1. 다음 용매를 추가하기 전에 액체가 투명한지 확인하십시오.
2. 용매를 순서대로 추가해야 합니다. 다음 용매를 추가하기 전에 이전 추가에서 얻은 용액이 투명한 용액인지 확인해야 합니다. 와동, 초음파 또는 뜨거운 물 중탕과 같은 물리적 방법을 사용하여 용해를 도울 수 있습니다.

작용 메커니즘 (Mechanism of Action)

Targets/IC50/Ki
HDAC1
(Cell-free assay)
7 nM(Ki)
HDAC3/SMRT
8.2 nM(Ki)
HDAC6
17 nM(Ki)
HDAC2
(Cell-free assay)
19 nM(Ki)
HDAC10
24 nM
HDAC8
280 nM
시험관 내(In vitro)
Abexinostat (PCI-24781)은 0.15 μM에서 3.09 μM 범위의 GI50 값을 가지며 다양한 종양 세포주에 대해 강력한 항종양 활성을 나타내고, 0.43 μM의 GI50으로 HUVEC 내피 세포에 대한 항증식 효과도 가지고 있습니다. 이 화합물로 처리하면 HCT116 또는 DLD-1 세포에서 아세틸화된 히스톤과 아세틸화된 튜불린의 용량 의존적 축적이 발생하며, p21의 발현을 유도하고, PARP 절단 및 γH2AX의 축적을 유도합니다. PCI-24781에 의한 HDAC 효소의 억제는 RAD51을 포함하여 HR과 구체적으로 관련된 유전자의 전사를 크게 감소시킵니다. HR 억제와 일치하게, 이는 형질전환된 CHO 세포에서 I-SceI 유도 염색체 파손의 상동 재조합 복구 수행 능력을 감소시킵니다. 이 화합물은 연조직 육종(STS) 세포에서 S기 고갈, G2 세포 주기 정지 및 세포 사멸을 유도하며, Rad51 근위 프로모터에 대한 E2F1 결합 강화로 매개될 가능성이 있는 STS 세포에서의 Rad51 전사 억제를 유발합니다. 추가적으로, 이 화합물은 호지킨 림프종 및 비호지킨 림프종 세포주에서 NF-κB 메커니즘을 통해 카스파제 및 활성 산소 종 의존적 세포 사멸을 유도합니다.
키나아제 분석
HDAC 활성
HDAC 활성은 연속적인 트립신 결합 분석을 사용하여 측정됩니다. 억제제 특성 분석을 위해 측정은 96-웰 분석 플레이트를 사용하여 100 μL의 반응 부피로 수행됩니다. 각 아이소자임에 대해, 반응 완충액[50 mM HEPES, 100 mM KCl, 0.001% Tween 20, 5% DMSO (pH 7.4), 0%(HDAC1), 0.01%(HDAC2, 3, 8, 10) 또는 0.05%(HDAC6) 농도의 소 혈청 알부민 첨가]에 담긴 HDAC 단백질을 다양한 농도의 Abexinostat (PCI-24781)와 혼합하고 15분 동안 배양합니다. 트립신을 50 nM의 최종 농도로 첨가하고, acetyl-Gly-Ala-(N-acetyl-Lys)-AMC를 25 μM(HDAC1, 3, 6), 50 μM(HDAC2 및 10) 또는 100 μM(HDAC8)의 최종 농도로 첨가하여 반응을 시작합니다. 음성 대조군 반응은 이 화합물이 없는 상태에서 8회 반복하여 수행됩니다. 반응은 형광 플레이트 판독기로 모니터링됩니다. 30분의 지연 시간 후, 355 nm의 여기 파장과 460 nm의 검출 파장을 사용하여 30분 동안 형광을 측정합니다. 시간 경과에 따른 형광 증가는 반응 속도의 척도로 사용됩니다. 억제 상수 Ki(app)는 프로그램 BatchKi를 사용하여 얻습니다.
생체 내(In vivo)
Abexinostat (PCI-24781)을 200 mg/kg 용량으로 격일(q.o.d.) 1회 투여한 결과, 마우스의 HCT116 및 DLD-1 이종이식 모델에서 종양 성장이 각각 69% 및 59% 유의하게 억제되었습니다. HCT116 모델에서 이 화합물을 매주 4일 연속 1회 투여하고 3일간 휴약하는 방식(q.d. × 4 per week)으로 20 mg/kg, 40 mg/kg, 80 mg/kg 또는 160 mg/kg 용량을 투여했을 때, 종양 성장 억제율은 각각 48%, 57%, 82.2% 또는 80.0%였습니다.
참조
  • [4] https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/19417023/

임상시험 정보 (Clinical Trial Information)

(데이터 출처 https://clinicaltrials.gov, 업데이트 날짜 2024-05-22)

NCT 번호 모집 조건 스폰서/협력자 시작일 단계
NCT05698524 Recruiting
Recurrent High Grade Glioma|Anaplastic Astrocytoma|Anaplastic Oligodendroglioma|Glioblastoma|Gliosarcoma
University of Nebraska|Xynomic Pharmaceuticals Inc.
 June 26 2023 Phase 1
NCT03934567 Recruiting
Lymphoma Follicular
Xynomic Pharmaceuticals Inc.
 April 22 2020 Phase 2
NCT03939182 Active not recruiting
Diffuse Large B-cell Lymphoma|Mantle Cell Lymphoma
Memorial Sloan Kettering Cancer Center|Janssen Scientific Affairs LLC|Xynomic Pharmaceuticals Inc.
 May 29 2019 Phase 1
NCT03600441 Active not recruiting
Follicular Lymphoma
Xynomic Pharmaceuticals Inc.
 August 27 2018 Phase 2
NCT01543763 Active not recruiting
Metastatic Solid Tumors
Pamela Munster|Pharmacyclics LLC.|Novartis|Xynomic Pharmaceuticals Inc.|GlaxoSmithKline Research and Education Foundation for Cardiovascular Disease|University of California San Francisco
 June 25 2012 Phase 1