연구용

PCI-34051 HDAC8 억제제

제품 번호S2012

PCI-34051은 세포 없는 분석에서 IC50이 10 nM인 강력하고 특이적인 HDAC8 억제제입니다. HDAC1 및 6에 비해 200배 이상, HDAC2, 3 및 10에 비해 1000배 이상의 선택성을 가집니다. PCI-34051은 카스파아제 의존성 apoptosis를 유도합니다.
PCI-34051 HDAC 억제제 Chemical Structure

화학 구조

분자량: 296.32

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품질 관리

배치: 순도: 99.79%
99.79

세포 배양, 처리 및 작업 농도

세포주 분석 유형 농도 배양 시간 제형 활성 설명 PMID
LAN1 Growth inhibition assay 72 hrs Growth inhibition of human LAN1 cells incubated for 72 hrs by MTS assay, GI50=3.9μM 23116147
Jurkat Growth inhibition assay 72 hrs Growth inhibition of human Jurkat cells incubated for 72 hrs by MTS assay, GI50=11μM 23116147
NB-1 Growth inhibition assay 72 hrs Growth inhibition of human NB-1 cells incubated for 72 hrs by MTS assay, GI50=14μM 23116147
MT2 Growth inhibition assay 72 hrs Growth inhibition of human MT2 cells incubated for 72 hrs by MTS assay, GI50=15μM 23116147
MT4 Growth inhibition assay 72 hrs Growth inhibition of human MT4 cells incubated for 72 hrs by MTS assay, GI50=25μM 23116147
Huh7 Antiviral assay 3 days Antiviral activity against HCV genotype 1b infected in human Huh7 cells after 3 days by luciferase reporter gene assay, EC50=1.8μM 25490700
HuH7 Cytotoxicity assay 3 days Cytotoxicity against human HuH7 cells assessed as inhibition of cell viability after 3 days by CellTiter 96 assay, CC50=11μM 25490700
Sf9 Function assay 5 mins Inhibition of recombinant full-length human C-terminal FLAG-His-tagged HDAC1 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using Boc-L-Lys(Ac)-AMC as substrate preincubated for 5 mins followed by substrate addition measured after 35 mins by fluoresce, IC50=3.8μM 28835796
Sf9 Function assay 5 mins Inhibition of recombinant human full-length C-terminal His-tagged HDAC3 (395 to 489 residues)/human NCOR2 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using Boc-L-Lys(Ac)-AMC as substrate pretreated for 5 mins followed by substrate addition measured, IC50=7.1μM 28835796
Sf9 Function assay 5 mins Inhibition of recombinant human full-length C-terminal His-tagged HDAC2 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using Boc-L-Lys(Ac)-AMC as substrate preincubated for 5 mins followed by substrate addition measured after 35 mins by fluorescence assay, IC50=31μM 28835796
SH-SY5Y Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human SH-SY5Y cells expressing TP53 by CellTiter96 AQueous one solution cell proliferation assay 28835796
IMR5 Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human IMR5 cells expressing TP53 by CellTiter96 AQueous one solution cell proliferation assay 28835796
SK-N-AS Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human SK-N-AS cells expressing TP53 mutation by CellTiter96 AQueous one solution cell proliferation assay 28835796
Kelly Cytotoxicity assay Cytotoxicity against human Kelly cells expressing TP53 mutation by CellTiter96 AQueous one solution cell proliferation assay 28835796
BE(2)-C Cytotoxicity assay 72 hrs Cytotoxicity against human BE(2)-C cells assessed as reduction in cell viability by measuring metabolic activity after 72 hrs by WST-8 assay, IC50=19.9μM 29190092
Sf9 Function assay 90 mins Inhibition of recombinant human full length C-terminal FLAG-tagged HDAC1 expressed in fall armyworm Sf9 cells using fluorogenic ZMAL as substrate after 90 mins by fluorimetric analysis, IC50=28.3μM 29190092
Sf9 Function assay 90 mins Inhibition of recombinant human full length HDAC6 expressed in fall armyworm Sf9 cells using fluorogenic ZMAL as substrate after 90 mins by fluorimetric analysis, IC50=48.2μM 29190092
BE(2)-C Function assay 6 uM 72 hrs Inhibition of HDAC8 in human BE(2)-C cells assessed as upregulation of p21/CDKN1 gene expression at 6 uM after 72 hrs by RT-PCR analysis relative to control 29190092
BE(2)-C Function assay 6 uM 72 hrs Inhibition of HDAC8 in human BE(2)-C cells assessed as upregulation of TrkA/NTRK1 gene expression at 6 uM after 72 hrs by RT-PCR analysis relative to control 29190092
BE(2)-C Function assay 6 uM 72 hrs Inhibition of HDAC8 in human BE(2)-C cells assessed as upregulation of TH gene expression at 6 uM after 72 hrs by RT-PCR analysis relative to control 29190092
BE(2)-C Function assay 6 uM 6 days Induction of outgrowth of neurofilament positive neutrite-like structures in human BE(2)-C cells at 6 uM after 6 days by DAPI-staining based microscopic analysis 29190092
A673 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for A673 cells 29435139
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
NB-EBc1 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB-EBc1 cells 29435139
SK-N-SH qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-SH cells 29435139
NB1643 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for NB1643 cells 29435139
LAN-5 qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for LAN-5 cells 29435139
Jurkat Antiproliferative assay Antiproliferative activity against human Jurkat cells by alamar blue assay, GI50=2.4μM 29505935
HUT78 Antiproliferative assay Antiproliferative activity against human HUT78 cells by alamar blue assay, GI50=2.4μM 29505935
HSB2 Antiproliferative assay Antiproliferative activity against human HSB2 cells by alamar blue assay, GI50=2.4μM 29505935
MOLT4 Antiproliferative assay Antiproliferative activity against human MOLT4 cells by alamar blue assay, GI50=2.4μM 29505935
Jurkat Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human Jurkat cells after 48 hrs by MTT assay, IC50=4.5μM 29533873
MOLT4 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human MOLT4 cells after 48 hrs by MTT assay, IC50=9.4μM 29533873
HEL Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human HEL cells after 48 hrs by MTT assay, IC50=10.8μM 29533873
SK-N-BE(2) Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human SK-N-BE(2) cells after 48 hrs by MTT assay, IC50=16.9μM 29533873
PC3 Antiproliferative assay 48 hrs Antiproliferative activity against human PC3 cells after 48 hrs by MTT assay, IC50=19.2μM 29533873
K562 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human K562 cells after 72 hrs by MTS assay, GI50=2.01μM 30004697
K562R Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human K562R cells after 72 hrs by MTS assay, GI50=2.2μM 30004697
HCT116 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human HCT116 cells after 72 hrs by MTS assay, GI50=2.64μM 30004697
PC3 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human PC3 cells after 72 hrs by MTS assay, GI50=2.66μM 30004697
MCF7 Antiproliferative assay 72 hrs Antiproliferative activity against human MCF7 cells after 72 hrs by MTS assay, GI50=2.97μM 30004697
BL21 (DE3) Function assay Binding affinity to human His-thioredoxin-tagged HDAC8 expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells by ITC method, Kd=0.0751μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of human His-thioredoxin-tagged HDAC8 expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=0.0777μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Binding affinity to Schistosoma mansoni His-tagged HDAC8 expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells by ITC method, Kd=0.367μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of Schistosoma mansoni His-tagged HDAC8 expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=0.4358μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of human His-thioredoxin-tagged HDAC8 mL6/L179I mutant expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=1μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of human His-thioredoxin-tagged HDAC8 mL6 mutant expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=1.63μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of human His-thioredoxin-tagged HDAC8 mL1/mL6 mutant expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=2.7μM 30347148
BL21 (DE3) Function assay Inhibition of human His-thioredoxin-tagged HDAC8 mL1/mL6/L179I mutant expressed in Escherichia coli BL21 (DE3) cells using Fluor de Lys (R)-HDAC8 as substrate by fluorometric method, IC50=5μM 30347148
Sf9 Function assay Inhibition of C-terminal FLAG/His-tagged full length human HDAC1 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using Z(Ac)Lys-AMC as substrate by fluorometric method, IC50=28.3μM 30347148
Sf9 Function assay Inhibition of N-terminal GST-tagged full length human HDAC6 expressed in baculovirus infected Sf9 insect cells using Z(Ac)Lys-AMC as substrate by fluorometric method, IC50=48.2μM 30347148
Sf9 Function assay 40 mins Inhibition of recombinant human full length C-terminal His-tagged HDAC8 expressed in baculovirus infected insect cells measured after 40 mins by HDAC-Glo1/2 luminescent assay, IC50=0.03162μM 30964290
SK-N-BE(2)C Anticlonogenic assay 96 hrs Anticlonogenic activity in human SK-N-BE(2)C cells assessed as reduction in cell proliferation incubated for 96 hrs by crystal violet staining based assay, GI50=15μM 31630054
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화학 정보, 보관 및 안정성

분자량 296.32 화학식

C17H16N2O3

보관 (수령일로부터)
CAS 번호 950762-95-5 SDF 다운로드 원액 보관

동의어 N/A Smiles COC1=CC=C(C=C1)CN2C=CC3=C2C=C(C=C3)C(=O)NO

용해도

In vitro
배치:

DMSO : 59 mg/mL (199.1 mM)
(수분으로 오염된 DMSO는 용해도를 감소시킬 수 있습니다. 신선하고 무수 DMSO를 사용하십시오.)

Water : Insoluble

Ethanol : Insoluble

몰농도 계산기

질량 농도 부피 분자량
희석 계산기 분자량 계산기

In vivo
배치:

생체 내 제형 계산기 (투명한 용액)

1단계: 아래 정보 입력 (권장: 실험 중 손실을 고려하여 추가 동물 포함)

mg/kg g μL

2단계: 생체 내 제형 입력 (이것은 계산기일 뿐 제형이 아닙니다. 용해도 섹션에 생체 내 제형이 없는 경우 먼저 당사에 문의하십시오.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

계산 결과:

작업 농도: mg/ml;

DMSO 원액 준비 방법: mg 약물 사전 용해 μL DMSO ( 원액 농도 mg/mL, 농도가 해당 약물 배치의 DMSO 용해도를 초과하는 경우 먼저 당사에 문의하십시오. )

생체 내 제형 준비 방법: 취하다 μL DMSO 원액, 다음 추가μL PEG300, 혼합하고 투명하게 한 다음 추가μL Tween 80, 혼합하고 투명하게 한 다음 추가 μL ddH2O, 혼합하고 투명하게 합니다.

생체 내 제형 준비 방법: 취하다 μL DMSO 원액, 다음 추가 μL 옥수수 기름, 혼합하고 투명하게 합니다.

참고: 1. 다음 용매를 추가하기 전에 액체가 투명한지 확인하십시오.
2. 용매를 순서대로 추가해야 합니다. 다음 용매를 추가하기 전에 이전 추가에서 얻은 용액이 투명한 용액인지 확인해야 합니다. 와동, 초음파 또는 뜨거운 물 중탕과 같은 물리적 방법을 사용하여 용해를 도울 수 있습니다.

작용 메커니즘

Targets/IC50/Ki
HDAC8
(Cell-free assay)
10 nM
시험관 내(In vitro)

PCI-34051은 Ki가 10 nM로 HDAC8에 대해 유망한 효능을 나타냅니다. 이 화합물은 HDAC1을 포함한 다른 클래스 I HDAC에 비해 HDAC8에 대해 높은 선택성(약 5배)을 가집니다. HDAC1 및 HDAC6에 대해 200배 이상, HDAC2, HDAC3 및 HDAC10에 대해 1000배 이상의 선택성을 나타냅니다. 이 화학 물질은 난소암 세포주 OVCAR-3를 6 μM의 GI50과 15%의 세포 사멸로 억제합니다. 24시간 또는 더 이른 시점에서 25 μM 미만의 농도로 이 화합물로 처리된 민감한 세포주에서는 유의미한 튜불린 또는 히스톤 아세틸화가 관찰되지 않습니다. 이 화합물은 T-세포 악성종양에서 유래한 세포주에서만 선택적인 세포 독성 효과를 유도합니다. 이 화합물은 카스파제 의존적 apoptosis를 유도합니다. 5 μM의 이 화학 물질로 처리 후 다양한 시간에서 카스파제-3 활성을 측정했을 때, 12시간에서 24시간, 48시간으로 갈수록 활성 수준이 증가하는 것이 관찰되며, 이는 apoptosis의 또 다른 특징으로, 이 시점에서 더 높은 카스파제 활성 수준과 일치합니다. 이는 외인성 apoptosis 경로의 특징적인 효과인 Bid 절단을 자극하지 않습니다. P116 및 J.RT3-T.5는 이 화합물에 민감한 반면, PLCγ1 결핍 J.gamma1 세포주는 유도된 apoptosis 정도가 현저히 감소하는 것을 보여줍니다. 또한, 정상 상태 칼슘 수준은 이 화학 물질에 의해 유도된 apoptosis에 강하게 영향을 미칩니다. 이는 미토콘드리아에서 사이토크롬 c 방출을 유도합니다.

키나아제 분석
히스톤 탈아세틸화 효소 활성
PCI-34051 특성화를 위해 96웰 분석 플레이트를 사용하여 형광 플레이트 리더에서 100 μL의 반응 부피로 측정을 수행합니다. 각 이소자임에 대해. 반응 버퍼(50 mM HEPES, 100 mM KCl, 0.001% Tween-20, 5% 디메틸 설폭사이드, pH 7.4, 0-0.05% 농도의 소 혈청 알부민으로 보충)에 HDAC 단백질을 다양한 농도의 이 화합물과 혼합하고 15분 동안 인큐베이션합니다. 트립신을 최종 농도 50 nM로 첨가하고, 아세틸-글리-알라-(N-아세틸-리신)-아미노-4-메틸쿠마린을 최종 농도 25-100 μM로 첨가하여 반응을 시작합니다. 30분 지연 시간 후, 335 nm의 여기 파장과 460 nm의 검출 파장을 사용하여 30분 시간 프레임 동안 형광을 측정합니다. 시간 경과에 따른 형광 증가는 반응 속도 측정으로 사용됩니다.
생체 내(In vivo)

PCI-34051은 강력하고 특이적인 HDAC8 억제제입니다.

참조

적용 분야

방법 바이오마커 이미지 PMID
Immunofluorescence SMC3 / Ac-SMC3
S2012-IF1
27072133

기술 지원

취급 설명서

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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