RG108 DNA Methyltransferase 억제제

제품 번호S2821

RG108 (N-프탈릴-L-트립토판)은 무세포 분석에서 IC50이 115 nM인 DNA methyltransferase 억제제이며, 이 화합물은 공유 효소의 트래핑을 유발하지 않습니다.
RG108 DNA Methyltransferase 억제제 Chemical Structure

화학 구조

분자량: 334.33

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품질 관리

배치: 순도: 99.82%
99.82

세포 배양, 처리 및 작업 농도

세포주 분석 유형 농도 배양 시간 제형 활성 설명 PMID
human THP1 cells Function assay Inhibition of ACAT-mediated esterified cholesterol accumulation in human THP1 cells exposed to acetyl-LDL during differentiation assessed as effect on foam cell formation, IC50=1.5 μM 18620381
human HepG2 cells Function assay Inhibition of ACAT in human HepG2 cells, IC50=0.479 μM 19167888
rat macrophages Function assay 24 h Inhibition of ACAT in rat macrophages assessed as incorporation of extracellular [3H]-oleic acid-BSA complex into the intracellular cholesteryl ester after 24 hrs, IC50=0.479 μM 19464189
MCF7 Apoptosis assay 10 uM 6 hrs Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as apoptotic cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control 25801160
MCF7 Apoptosis assay 10 uM 6 hrs Induction of apoptosis in human MCF7 cells assessed as dead cells at 10 uM after 6 hrs by FITC-Annexin V/propidium iodide staining-based FACS analysis relative to control 25801160
MCF7 Function assay 100 uM 1 hr Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 100 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 30 mins and clicked with TER-PE 25801160
MCF7 Function assay 50 to 500 uM 1 hr Competitive inhibition of DNMT1 in (S)-Methyl 2-(2,5-dioxo-2,5-dihydro-1H-pyrrol-1-yl)-3-(5-(prop-2-yn-1-yloxy)-1H-indol-3-yl)propanoate labeled human MCF7 cells at 50 to 500 uM preincubated for 1 hr followed by cell labeling for 1 hr and clicked with TER 25801160
SK-N-MC qHTS assay qHTS of pediatric cancer cell lines to identify multiple opportunities for drug repurposing: Primary screen for SK-N-MC cells 29435139
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화학 정보, 보관 및 안정성

분자량 334.33 화학식

C19H14N2O4

보관 (수령일로부터)
CAS 번호 48208-26-0 SDF 다운로드 원액 보관

동의어 N-Phthalyl-L-tryptophan Smiles C1=CC=C2C(=C1)C(=O)N(C2=O)C(CC3=CNC4=CC=CC=C43)C(=O)O

용해도

In vitro
배치:

DMSO : 66 mg/mL (197.4 mM)
(수분으로 오염된 DMSO는 용해도를 감소시킬 수 있습니다. 신선하고 무수 DMSO를 사용하십시오.)

Ethanol : 66 mg/mL

Water : Insoluble

몰농도 계산기

질량 농도 부피 분자량
희석 계산기 분자량 계산기

In vivo
배치:

생체 내 제형 계산기 (투명한 용액)

1단계: 아래 정보 입력 (권장: 실험 중 손실을 고려하여 추가 동물 포함)

mg/kg g μL

2단계: 생체 내 제형 입력 (이것은 계산기일 뿐 제형이 아닙니다. 용해도 섹션에 생체 내 제형이 없는 경우 먼저 당사에 문의하십시오.)

% DMSO % % Tween 80 % ddH2O
%DMSO %

계산 결과:

작업 농도: mg/ml;

DMSO 원액 준비 방법: mg 약물 사전 용해 μL DMSO ( 원액 농도 mg/mL, 농도가 해당 약물 배치의 DMSO 용해도를 초과하는 경우 먼저 당사에 문의하십시오. )

생체 내 제형 준비 방법: 취하다 μL DMSO 원액, 다음 추가μL PEG300, 혼합하고 투명하게 한 다음 추가μL Tween 80, 혼합하고 투명하게 한 다음 추가 μL ddH2O, 혼합하고 투명하게 합니다.

생체 내 제형 준비 방법: 취하다 μL DMSO 원액, 다음 추가 μL 옥수수 기름, 혼합하고 투명하게 합니다.

참고: 1. 다음 용매를 추가하기 전에 액체가 투명한지 확인하십시오.
2. 용매를 순서대로 추가해야 합니다. 다음 용매를 추가하기 전에 이전 추가에서 얻은 용액이 투명한 용액인지 확인해야 합니다. 와동, 초음파 또는 뜨거운 물 중탕과 같은 물리적 방법을 사용하여 용해를 도울 수 있습니다.

작용 메커니즘

Targets/IC50/Ki
DNA methyltransferase
(Cell-free assay)
115 nM
시험관 내(In vitro)
RG108은 시험관 내에서 DNA methyltransferase를 효과적으로 차단하며, 인간 세포주에서 공유 효소 트래핑을 유발하지 않습니다. 이 화합물의 낮은 마이크로몰 농도로 세포를 배양하면 검출 가능한 독성 없이 게놈 DNA의 상당한 탈메틸화를 초래합니다. 흥미롭게도, 이는 종양 억제 유전자의 탈메틸화 및 재활성화를 유발하지만, 중심체 위성 서열의 메틸화에는 영향을 미치지 않습니다. 다른 연구에서는 DNA methyltransferase 효소와의 상호 작용을 평가하기 위해 이 화학 물질의 바이오틴화된 접합체의 합성 및 시험관 내 분석이 조사됩니다. 최근 연구에서는 이 화합물이 원시 SM에 비해 SM 유래 iPS 세포에서 DNA methyltransferase 활성을 유의하게 감소시킬 수 있음이 밝혀졌습니다.
키나아제 분석
시험관 내 메틸화 분석
시험관 내 메틸화 분석을 위한 기질 DNA는 인간 p16Ink4a 유전자의 프로모터 영역에서 유래한 798 bp 단편(개시 코돈 대비 -423/+375)입니다. 메틸화 반응은 최종 부피 50 μL에 350~400 ng의 기질 DNA와 4단위의 M.SssI 메틸레이스(0.5 μM)를 포함합니다. 이 화합물은 각각 10, 100, 200 및 500 μM의 최종 농도로 첨가됩니다. 반응은 37 °C에서 2시간 동안 수행됩니다. 완료 후, 반응은 65 °C에서 15분 동안 불활성화되고 DNA는 PCR 정제 키트를 사용하여 정제됩니다. 정제된 DNA 300 나노그램은 60 °C에서 3시간 동안 30단위의 BstUI로 소화되고 2% 트리스-붕산 EDTA 아가로스 젤에서 분석됩니다.
참조

기술 지원

취급 설명서

Tel: +1-832-582-8158 Ext:3

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